# AstroResearch Database Schema / 数据库设计

AstroResearch 使用轻量级、零配置的 **SQLite** 数据库作为持久化存储。数据库文件默认保存在项目根目录下的 `astro_research.db`，由 Rust 中的 `sqlx` 驱动管理并自动执行迁移。

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## 1. 实体关系图 (Entity-Relationship Diagram)

```mermaid
erDiagram
    PAPERS {
        text bibcode PK
        text title
        text authors "JSON Array"
        text year
        text pub "Journal/Publisher"
        text keywords "JSON Array"
        text abstract
        text doi
        text arxiv_id
        integer citation_count
        integer reference_count
        text pdf_path
        text html_path
        text markdown_path
        text translation_path
        datetime created_at
    }

    NOTES {
        integer id PK
        text bibcode FK
        integer paragraph_index
        text note_text
        text highlight_color
        text selected_text
        datetime created_at
    }

    CITATIONS_REFERENCES {
        text source_bibcode PK
        text target_bibcode PK
    }

    PAPERS ||--o{ NOTES : "has"
    PAPERS ||--o{ CITATIONS_REFERENCES : "cites / cited_by"
```

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## 2. 数据表结构详述 (Table Schema Details)

### 2.1 papers 表 (文献元数据)
存储文献的核心元数据和本地物理存储路径。
- **索引**：
  - `idx_papers_doi` -> 基于 `doi`
  - `idx_papers_arxiv_id` -> 基于 `arxiv_id`

### 2.2 citations_references 表 (引文与参考文献拓扑)
多对多关联表，存储文献之间的引用网络（即拓扑星系图的基础数据）。
- **复合主键**：`(source_bibcode, target_bibcode)`
- **索引**：
  - `idx_citations_ref_source` -> 优化以 `source_bibcode` 查询参考文献
  - `idx_citations_ref_target` -> 优化以 `target_bibcode` 查询被引文献

### 2.3 notes 表 (高亮与阅读笔记)
存储学者在阅读器中对特定段落创建的高亮和笔记。
- **外键**：`bibcode` 级联删除 (`ON DELETE CASCADE`)。
- **索引**：
  - `idx_notes_bibcode` -> 优化单篇文献的笔记列表查询。

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## 3. 数据库迁移说明
迁移脚本存放在 `migrations/` 下，服务启动时（`src/main.rs`）会自动调用 `sqlx::migrate!().run(&pool).await` 自动部署：
1. `20260608000000_init.sql`：初始化 `papers` 与 `citations_references` 结构。
2. `20260608000001_notes.sql`：添加 `notes` 笔记高亮表，并为关联建立级联删除。