Asfmq
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- AgentConfig/LlmClient 新增 enable_thinking 参数，前端 SSE 请求传递 thinking 开关，仅千问/DashScope 时启用 - 完善权限系统，支持细粒度的权限控制和用户权限申请 - delegate_research 工具重命名为 subagent，SubAgentTool/SubAgentRunner 重构 - 子代理消息（system/user/assistant/tool）持久化到 agent_messages 表，带 agent_name 标识 - 子代理活动日志（工具调用列表+思考摘要）注入返回结果，Hooks 获得正确 session_id 和 subagent_name - LLM 工具调用 ID 回退生成 UUID（llm.rs），ToolCall/ToolResult SSE 事件增加 id/tool_call_id 双字段 - ToolContext 扩展 session_id/sse_tx/enable_thinking 字段，executor 统一注入而非构造函数传参 - agent_messages 新增 metadata+raw_json 列，agent_sessions 暴露 summary 字段 - 删除文件级 transcript 快照（compact.rs），改为依赖 DB 持久化 - ResearchAgentPanel 重写：TimelineItem 类型替代 StreamStep，支持会话历史回放 - 新增 AgentMetricsPanel/AskUserQuestionCard/AuditLogViewer 三个前端组件，types.ts 完整类型定义 - docs/architecture/ 分层重组：概览/核心模块/核心工作流 + agent/ 子目录 11 篇专题文档 - docs/api.md 补充 RAG/Target/Agent 接口，docs/development.md 新建开发指南 - .env.example 完全重写，补充 FALLBACK_MODEL 等变量说明
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TOML
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# 权限配置档案：科研模式
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# 允许文件操作和学术文献下载，禁止危险 Shell 命令。
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# 加载方式：AGENT_PERMISSION_PROFILE=research
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[profile]
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name = "research"
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description = "科研模式 — 允许文件 I/O、文献下载，禁止危险 Shell 命令"
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[permissions]
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deny = [
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"run_bash(rm *)",
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"run_bash(sudo)",
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"run_bash(chmod)",
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"run_bash(chown)",
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"run_bash(mkfs)",
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"run_bash(dd )",
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"run_bash(> /)",
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]
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ask = [
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"run_bash",
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"file_write",
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"file_edit",
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]
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allow = [
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"read_file",
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"grep_files",
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"glob_files",
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"search_papers",
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"get_paper_metadata",
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"get_paper_content",
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"download_paper",
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"parse_paper",
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"rag_search",
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"query_target",
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"save_note",
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"load_skill",
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]
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mode = "default"
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