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DCTS/docs/database.md
T
fmq d16b3d3cdc feat(all): 数据库模块化拆分与版本化迁移、任务引擎命名体系收敛、物理输出校验加固与用户配置接通
- server/db: 拆 4929 行 db.rs 单体为 db/ 目录,migrations.rs 引入 PRAGMA user_version
    版本化迁移运行器(M1~M13)
  - 任务引擎 Phase 6/7b/7c 改名收敛:EngineStageConfig→PhaseConfig、StagePolicy→ResumePolicy、
    Converged→Completed、删除 task_type 列、success_method 拆 tlusty_/synspec_ 双列、
    新增 tlusty_status/synspec_status 半失败阶段守卫
  - 科学正确性加固:conv_check 任意行 NaN/Inf/溢出判无效(0 行容忍)、新增 spec_is_valid
    校验 SYNSPEC 脏谱、itek_history 逐次迭代全量保真、fmt_abn powf 溢出饱和
  - 用户配置真正接通:tlusty_chain/tlusty_input 由死字段经 调度器→TaskSpec→executor→runner
    透传生效;config 加载期 validate + deny_unknown_fields + 解析失败记 warn
  - 调度修复:H1 活锁(pending_strategies 跳过已失败策略)、种子查找错误不再静默降级冷启动
  - dashboard: 阶段配置面板 tlusty_stage/synspec_stage、"已完成"标签、迭代诊断展示
  - docs: 新增 database_refactor_design.md,同步 database/api/PIPELINE/workflow_detail
2026-08-06 20:51:21 +08:00

14 KiB
Raw Blame History

DCTS 数据库设计 (Database Schema)

DCTS 采用轻量级、零配置、高并发安全的 SQLite 双数据库架构:主状态库 dcts.db 存储网格结构与历史记录;队列库 dcts_queue.dbmq 驱动管理原子任务状态机。


1. 数据库分库架构

erDiagram
    WORKFLOWS ||--o{ GRID_POINTS : contains
    GRID_POINTS ||--o{ TASKS : logs
    WORKFLOWS ||--o{ WORKFLOW_PROGRESS_SNAPSHOTS : samples
    NODES ||--o{ TASK_QUEUE : executes
    NODES ||--o| NODE_CREDENTIALS : authenticates
    SEEDS }o--o{ GRID_POINTS : hot-starts

    subgraph PrimaryDB ["主数据库 (dcts.db)"]
        WORKFLOWS {
            string name PK
            string description
            text config_yaml
            string status
            datetime created_at
            datetime updated_at
        }
        GRID_POINTS {
            integer id PK
            string name
            string workflow_name FK
            double teff
            double logg
            double loghe
            double logc
            double logn
            double logo
            double cno_sum
            integer wave
            string status
            integer attempt_count
            string tlusty_success_method
            string synspec_success_method
            double last_elapsed_sec
        }
        TASKS {
            string task_id PK
            string point_name
            string node_id
            string seed_point_name
            string status
            double max_relc
            boolean atmosphere_has_nan
            integer retry_count
            datetime created_at
            datetime started_at
            datetime completed_at
            string error_message
            string workflow_name
            boolean tlusty_enabled
            string tlusty_policy
            text tlusty_strategies
            boolean synspec_enabled
            string synspec_policy
            text synspec_strategies
            string atmosphere_ref
            double elapsed_sec
            string failed_stage
            text summary_json
        }
        NODES {
            string node_id PK
            integer max_slots
            integer active_slots
            string status
            double cpu_usage
            double memory_usage
            datetime last_heartbeat
            string registration_secret
            integer admin_max_slots
        }
        NODE_CREDENTIALS {
            string node_id PK
            string token_hash
            datetime issued_at
            string raw_token_pending
        }
        SEEDS {
            integer id PK
            string point_name UK
            double teff
            double logg
            double loghe
            double logc
            double logn
            double logo
            string file_path
            boolean is_clean
        }
        WORKFLOW_PROGRESS_SNAPSHOTS {
            integer id PK
            string workflow_name
            datetime ts
            integer total
            integer pending
            integer queued
            integer running
            integer completed
            integer failed
        }
    end

    subgraph QueueDB ["队列库 (dcts_queue.db / mq)"]
        TASK_QUEUE {
            string task_id PK
            string payload
            string status
            datetime created_at
            datetime claimed_at
            string workflow_name
            string claimed_by_node_id
            integer wave
        }
    end

2. 表结构定义 (Schema Specification)

2.1 workflows (工作流配置表)

存储用户定义的计算网格配置及整体状态。

  • name (TEXT PRIMARY KEY):工作流唯一标志(如 sdB_cno)。
  • description (TEXT):描述信息。
  • config_yaml (TEXT NOT NULL):完整的参数网格定义与物理配置 YAML 内容。
  • status (TEXT NOT NULL DEFAULT 'idle')idle(就绪)→ initializing(原子抢占加载中)→ running(运行中)/ 回退 idlerunningpaused(暂停)/ completed(全部网格点收敛)。
  • created_at / updated_at (DATETIME NOT NULL):创建 / 最后更新时间。

2.2 grid_points (网格点物理参数表)

存储多维笛卡尔积展开后的每一个独立参数点。

  • id (INTEGER PRIMARY KEY AUTOINCREMENT):自增主键。
  • name (TEXT NOT NULL):点物理唯一名(由 6 维参数生成,如 t35000_g5.5_he-1_c-2_n-2_o-2)。
  • workflow_name (TEXT NOT NULL):所属工作流。多工作流分区键——同一物理点可属于多个工作流, 与 name 共同构成复合唯一约束 UNIQUE(workflow_name, name)
  • teff, logg, loghe, logc, logn, logo (REAL NOT NULL)6 维物理参数。
  • cno_sum (REAL NOT NULL)CNO 丰度之和(调度排序用)。
  • wave (INTEGER NOT NULL DEFAULT 0):按 cno_sum 分组的批次波次(调度优先级用)。
  • status (VARCHAR(32))pending / queued / running / completed / failed7c 由 converged 改名,M9 迁移)。
  • attempt_count (INTEGER):失败重试计数(仅观测用)。
  • tlusty_success_method (VARCHAR(32))大气收敛归因(P9 拆分)——TLUSTY 阶段以何策略收敛 (cold_run 冷启动成功 / seed_step 种子步进成功 / 策略名)TLUSTY 禁用(synspec-only)为 NULL。 Phase 6 起由 tlusty_strategies[0] 派生。整体归因由消费方派生(tlusty ?? synspec)。
  • synspec_success_method (VARCHAR(32))光谱收敛归因Phase 5a)——synspec 阶段以何策略收敛 (如 standard);TLUSTY-only 成功为 NULL。解锁"光谱以 standard 等策略收敛了多少点"的统计与过滤。
  • last_elapsed_sec (REAL):最近一次尝试的墙钟耗时(详情页 ETA 估算用,兼容旧数据回退)。

多工作流分区(per-workflow partitioninggrid_pointstask_queue 均按 workflow_name 隔离。 调度、状态更新、stale 重投、stop_workflow 重置都限定在单个工作流内,互不影响。 历史旧库(无 workflow_name 列)在启动时自动迁移:表重建为复合唯一结构,旧行 workflow_name 标记为 __legacy__,不干扰新工作流查询。

2.3 tasks (任务尝试记录表)

每次派发/尝试生成一行,记录任务的阶段配置快照与执行结果(详情页/归因/回退弹栈的数据源)。

  • task_id (VARCHAR(128) PRIMARY KEY):任务 IDUUID)。
  • point_name (TEXT NOT NULL):网格点权威名(源精度,非 params 重推)。
  • node_id (TEXT):执行节点 ID。
  • seed_point_name (TEXT):种子步进时注入的近邻种子点(GET /api/seed/<name> 下载依据)。 双义SYNSPEC-onlyTLUSTY 关闭)时恒为 NULL(大气来源见 atmosphere_ref)。
  • status (VARCHAR(32))pending / claimed / running / completed / failed / timeout
  • max_relc (REAL):最终最大相对变化(收敛判据量)。
  • atmosphere_has_nan (BOOLEAN):最终大气是否含 >10% NaN 行(无效化标记)。
  • retry_count (INTEGER):重试计数。
  • created_at / started_at / completed_at (DATETIME):创建 / 开始 / 完成时间。
  • error_message (TEXT):失败原因(含 synspec 错误/超时等)。
  • workflow_name (TEXT):所属工作流(多工作流分区键)。
  • 阶段独立配置快照(派发时落库)tlusty_enabled (BOOLEAN)、tlusty_policy (TEXT)、 tlusty_strategies (JSON)、synspec_enabled (BOOLEAN)、synspec_policy (TEXT)、 synspec_strategies (JSON)、atmosphere_ref (TEXT,显式大气来源点)。 回退时弹 *_strategies 链首(见 task_engine_decoupling_design.md §4.2),policy/策略链取派发时快照。
  • elapsed_sec (REAL):任务墙钟耗时(详情页 ETA 估算优先用此值)。
  • failed_stage (TEXT):失败阶段归因("tlusty" / "synspec";旧节点/旧行 NULL → 服务端兜底按 TLUSTY 归因)。
  • summary_json (TEXT):完整 ModelSummary JSON(含 synspec_rc/synspec_error/synspec_sec 与各子步骤摘要); 错误路径为 {"error": ...}全量保真Phase 5b 起):逐次 itek 迭代诊断 (itek_history: [{iter, max_relc, n_depths}])随 summary_json 落库,与 conv.json 同源。

2.4 nodes (计算节点心跳与状态表)

  • node_id (TEXT PRIMARY KEY):节点唯一标识(未指定 DCTS_NODE_ID 时自动生成 node-<uuid>)。
  • max_slots (INTEGER NOT NULL):节点声明的最大并发计算槽位数(即 DCTS_MAX_SLOTS,领用上限)。
  • active_slots (INTEGER NOT NULL DEFAULT 0):当前正在执行的任务数,随 claim 自增、report 完结自减。
  • status (VARCHAR(32) NOT NULL DEFAULT 'online')pending_approval(注册待审批)/ online(在线)/ offline(心跳超时离线)/ disabled(管理员手动停用,保持心跳但不再分发任务)/ rejected
  • cpu_usage / memory_usage (REAL NOT NULL DEFAULT 0.0):心跳上报的 CPU/内存使用率(仅观测展示用,不参与任务分发决策)。
  • last_heartbeat (DATETIME NOT NULL):最后一次心跳上报时间,后台线程据此判定 online → offline
  • registration_secret (TEXT):节点注册时下发的一次性凭据,用于 /node/check_status 取走专属 token 的二次鉴权。
  • admin_max_slots (INTEGER,可空):管理员强制并发槽位配额(NULL = 无限制,沿用物理 max_slots),经心跳响应下发给节点动态生效。

2.5 node_credentials (节点 L2 鉴权凭据表)

  • node_id (TEXT PRIMARY KEY):关联 nodes.node_id
  • token_hash (TEXT NOT NULL):节点专属 token 的 SHA-256 哈希(不存明文)。
  • issued_at (DATETIME NOT NULL):颁发时间。
  • raw_token_pending (TEXT):暂存待确认的明文 token(颁发流程过渡用,确认后清除)。

token 失效靠重发覆盖 token_hash(旧 hash 不存在 → 鉴权失败),无独立吊销标记; 历史 revoked 死列已由迁移 M4 清除(Phase 4)。

2.6 seeds (种子缓存池表)

全局共享的已收敛大气 .7 索引(跨工作流复用,种子步进热启动数据源)。

  • id (INTEGER PRIMARY KEY AUTOINCREMENT)。
  • point_name (TEXT UNIQUE NOT NULL):种子点权威名(源精度,与磁盘文件名一致)。
  • teff, logg, loghe, logc, logn, logo (REAL NOT NULL):6 维物理参数(种子匹配距离计算用)。
  • file_path (TEXT NOT NULL).7 大气文件在 seeds_dir 的路径。
  • is_clean (BOOLEAN NOT NULL DEFAULT 1):大气是否干净(无 NaN)——仅干净种子可被匹配(reload_seed_cache 只加载 is_clean=1)。

运行期维护内存 seed_cache + seed_indexexact_family 桶索引),find_best_seed_from_db 先查桶索引(O(1)~O(小)),未命中退化为全量 global 扫描(见 seed_finder.rs / design.md §3)。

2.7 workflow_progress_snapshots (工作流进度时间序列表)

后台定期(每分钟)为每个 running 工作流记录进度计数,供详情页进度曲线与 ETA 估算。

  • id (INTEGER PRIMARY KEY AUTOINCREMENT)。
  • workflow_name (TEXT NOT NULL)。
  • ts (DATETIME NOT NULL DEFAULT (datetime('now'))):采样时间。
  • total / pending / queued / running / completed / failed7c 由 converged 改名,M9 迁移) (INTEGER NOT NULL):该时刻各状态计数。

2.8 task_queue (分布式任务队列表 - mq)

驱动分布式抢占与超时重试的核心表,使用 SQLite WAL 模式确保高吞吐并发安全(详见 sqlite_queue.rs)。

  • task_id (VARCHAR(128) PRIMARY KEY):任务 IDUUID)。
  • payload (TEXT NOT NULL):序列化的 TaskSpec (含 point_name / params / seed_point_name / workflow_name / tlusty_config / synspec_config 等; Phase 6 起无 task_type 字段,执行链由 tlusty_config.strategies[0] 派生)。
  • status (TEXT NOT NULL)pending(就绪待领用)/ claimed(已被某 node 领用,计算中)。
  • created_at (DATETIME NOT NULL):推入队列时间(同 wave 内 FIFO 排序键)。
  • claimed_at (DATETIME):被领用的时间戳(requeue_stale_tasks 据此判定超时回投)。
  • workflow_name (TEXT):所属工作流(多工作流分区键)。
  • claimed_by_node_id (TEXT):领用方节点 IDclaim 时写入,report 阶段据此校验归属,防跨节点伪造)。
  • wave (INTEGER NOT NULL DEFAULT 0):难度波次(pop_task 出队第一排序键,低 wave 优先)。

任务完成后由 remove_task 直接从本表删除(不保留 completed/failed 终态行),历史记录落在主库 tasks 表。超时的 claimed 行由 requeue_stale_tasks 改回 pending 重投。


3. 并发与事务安全设计

  1. WAL (Write-Ahead Logging) 模式SQLite 连接自动启用 PRAGMA journal_mode=WAL;PRAGMA busy_timeout=15000;,解决多线程/多进程读写锁竞争。
  2. 连接池机制:借助 r2d2 + r2d2_sqlite 维护异步连接池,防止高并发下数据库句柄冲突。
  3. 原子 Claim 事务:任务抢占在单个 IMMEDIATE 事务内完成——先 SELECT ... WHERE status='pending' ORDER BY wave ASC, created_at ASC LIMIT 1 取队首,再 UPDATE SET status='claimed', claimed_by_node_id=?,提交后返回。事务保证同一任务不会被两个 node 同时领用;遇到 SQLITE_BUSY/LOCKED 最多退避重试 5 次(详见 pop_task)。
  4. 凭据零明文存储node_credentials.token_hash 只存 SHA-256 哈希;节点注册的一次性 registration_secret 也仅在审批前短期有效,避免数据库泄漏直接泄露有效 token。